К продолжению рода крокодилы относятся очень ответственно. Во время брачного периода, крокодилы становятся более подвижны, легковозбудимы, повышается агрессивность самцов. При виде возможного соперника, самец-крокодил тут же завязывает жестокий бой, в котором нередко животные наносят друг-другу смертельные раны.
Для привлечения самок самцы рептилий могут рычать, издавать горловые звуки, бить челюстями по воде и выделять сильный мускусный секрет.
Самка в это время занята строительством гнезда на своей территории из гниющих веток и ила. В пасти она носит комья грязи и пучки травы, складывая стройматериал в одно место и формируя высокую кучу. В высоту гнездо достигает метра, и около двух метров в основании. На вершине холмика самка делает углубление, в которое и откладывает до восьмидесяти яиц. Отложив яйца и прикрыв место кладки землей, самка покидает гнездо и располагается рядом, бдительно охраняя будущее потомство, нападая на каждого, кто имел неосторожность приблизиться к гнезду.
Свою готовность к вылуплению, детеныши сообщают матери сквозь скорлупу яиц особыми квакающими звуками. Тогда самка крокодила аккуратно откапывает кладку и помогает крокодильчикам выбраться наружу, раскалывая скорлупу каждого яйца.
Детеныши рождаются уже вполне сформированными и готовыми постоять за себя. Опека матери продолжается до трех месяцев. У некоторых видов крокодилов в заботе над детенышами принимает участие и отец наравне с матерью. Крокодильчики стараются держаться кучно и при малейшей опасности начинают громко кричать, призывая мать на помощь. Однако, несмотря на неусыпную заботу родителей, детеныши крокодилов часто становятся жертвами хищных животных и птиц.